这一地区的基督宗教主要是天主教，已有一百多年的历史，与周边的佛教、伊斯兰教民众相处和谐。具体情况如下：
一、传入与发展
天主教，亦称公教、罗马公教、加特力教。有时也称旧教，以区别于基督新教，俗称“洋教”，是基督教三大派别之一。“天主”一词，为明末耶稣会传教士借用中国原有名称，对信仰之神的译称，取意为“至高至上的主宰”。
1861年，经罗马教廷批准，内蒙古的法国遣使会由新成立的比利时圣母圣心会接管。1865年12月6日，圣母圣心会会祖南怀仁，率领韩默理等5人，来到察哈尔西湾子（今河北省崇礼县），由法国遣使会白代权司铎之手，接受内蒙古传教事务。1872年，巴耆贤主教将内蒙古分为东、中、西3个传教分区，当时鄂旗归西分区。
1874年2月，圣母圣心会巴耆贤主教派德玉明、魏林敦俩司铎，由藏族向导萨木腾金巴带领，路经归化城，于4月7日来到包日巴拉嘎苏（今城川），后又转到柠条梁（蒙名苏亥班升），两位司铎就地搭帐篷，开始教务活动。7月，德、魏二司铎，在包日巴拉嘎苏的苏坝海子（蒙名苏吾格），盖起3间柳笆屋作为堂口，有3户蒙古人入教。这是旗境内第一座天主教堂。不久，又在包日巴拉嘎苏寨子内，建起一座10间屋规模的教堂。之后柠条梁，小桥畔（蒙名合热格）也陆续建起教堂，教民发展到近千户。
1905年，柠条梁教堂发展为西南蒙古教区南段的主教堂负责管辖伊克昭盟（今鄂尔多斯市，简称伊盟）南部教务和三边宁夏部分教堂。1922年，罗马教廷，把西南蒙古教区分为宁夏和绥远两个教区，鄂旗地区的教堂划规宁夏教区。
1946年7月6日，教廷将中国的139个代牧区和监牧区，分为20个教省，旗境内教堂归蒙古教省的宁夏教区。
二、蒙地教堂
德、魏二司铎在蒙地传教，是利用萨木腾金巴的特殊身分打开的局面。
萨木腾金巴是一名藏族喇嘛，曾是柳贵湾（蒙名吾达木都道亥）一带的喇嘛，为寻求宗教的真谛，到西湾子教堂，与传教士对各自信仰的宗教进行辩论，结果输于传教士。于是皈依天主教，充当天主教向内蒙古西部扩展教区时的向导。他懂得藏、蒙、汉、比利时4种语言。对天主教在蒙地的扩展，起一定的作用。天主教在蒙古族地区传教困难很大，到1876年，入教的蒙古人仍为3户，1877年，是个大旱年，教区的牲畜损失惨重，所剩无几。很多牧民为求生存而入教，教民发展到100余户。
翌年，年景好转，教民又纷纷还俗。为此，闵玉清司铎特地从包头买了110头牛，辗转伊盟7旗，分送给缺牛户，回到包日巴拉嘎苏时，将剩下的十几头牛，全部送给教民。这次的救济活动影响很大，很多牧民纷纷入教。当时入教的蒙古族教民生活待遇比一般蒙民高，所以很吸引人心。巴主教视察包日巴拉嘎苏教堂后，确定将此地发展为一个纯蒙古教区，汉族人想在此地入教，必须先加入蒙古籍，取蒙古名，生活习惯随蒙古族。这部分教民，称为“随旗蒙人”。
1878年，闵玉清司铎接管包日巴拉嘎苏堂口，开始使用蒙语教义，教民可直接用蒙语唱诵。
包日巴拉嘎苏一带的蒙古族教民与其他地区信仰喇嘛教的蒙古人，由于受“洋教”的影响，在生活习惯和思维方式上有明显的不同。入教时先学习教义、教规和简单易懂的经文，叫“望教阶段”。然后由神父主持举行入教仪式，叫“领洗”或“受洗”，受洗后即成为教民。
教民取消在屋前供奉的禄马杆和专设的佛屋及一年四季的佛事活动。他们在屋里墙壁上挂耶酥像，圣母马利亚像和十字架。守天主十诫，圣教四规。他们每星期到教堂诵经，听经。用饭前向主祈祷。他们庆祝的节日有圣诞节、天主四大瞻礼和八大节日，取消每年腊月24日的祭火，一年的祭敖包和腊月30晚上祭先人的仪式。改为清明节在祖先墓上洒圣水祈祷。取消出远门择日子、宰羊规矩、吃羊肉的讲究，放马鞍子的方向等原生活禁忌。婚事在教民之间进行，不得同信仰喇嘛教的蒙古人通婚。婚事要在男女双方同意的前提下进行，婚礼由神父在教堂主持，然后回到男方家举行典礼仪式。
丧事比较简单，死者用棺材收殓。尸体横放，由神父主持作诵祷、入殓礼、献香礼、告别礼（洒圣水）。墓穴为坑式和洞式两种，立墓碑，树十字架，教区有一个墓地。尸体停放3天，出殡后即可解孝。
包日巴拉嘎苏教堂，设在今城川中学所在地。堂内设坐堂神父、公会会长、大掌柜、二掌柜、三掌柜、会计先生等。1886—1887年，由袁万福、闵玉清司铎，在今珠和苏木克泊日和乌审旗小石砭增设两座分堂，小石砭分堂无坐堂神父。1900年，3座堂口全被独贵龙和红灯照烧毁。1901年，包日巴拉嘎苏堂口重新建起，可容纳1000余教民。
1941年，贺歌南任包日巴拉嘎苏教堂神父后，在新寨子建起一座分堂，堂内设一医疗诊所，接着在糜地梁的查干陶勒盖建起一座马利亚小教堂。到鄂托克旗解放，在旗境内先后建起5座堂口，教民发展到1000余人，培养出蒙古族神父3人，修女8人。
三、汉地教堂
现陕西的堆子梁（蒙名宝德热根纳塔拉）、白泥井（蒙名巴音都克木），小桥畔，柠条梁一带，原为鄂旗的土地，当时汉族人不断迁入，蒙古人北移，故称为汉地。在汉地建造的教堂有：
柠条梁主堂，1875年，由德玉明，魏林敦建造。1894年设西南蒙古教区时，分管西南蒙古教区南段。先后有10名外籍司铎坐堂神父，他们是闵玉清、杨光被、巴士英、南怀义、白文治、闫明治、叶司铎、甘英中、彭寿年（松寿）、葛永勉等人。1901年的赔款会盟在该堂举行。
小桥畔分堂，1879年建造，当时有教民240户，800余人。
白泥井分堂，1902年建造，当时有教民150户，700余人。
堆子梁分堂，1902年建造，教民曾发展到120户，500余人。
毛团圐圙分堂（蒙名毛毛音库热），当时有教民443人。
黑梁头（蒙名哈热希里）分堂，曾有教民300余人。
仓房梁（蒙名敖包希里）分堂，曾有教民320人。
硬地梁（蒙名嘎图希里）分堂，曾有教民630人。
另外还有柳贵湾（蒙名乌达木都道亥），大羊湾（蒙名浩尼毕勒其热）、沙路茅子和胡家窑子等分教堂。
四、慈善机构
1901年，巴士英司铎，在包日巴拉嘎苏教堂办起一座育婴堂，主要收养孤儿和遗弃的婴儿及贫民养活不起送到教堂的婴幼儿。育婴堂设长书房和冬书房，长书房为长期设置，一年四季开办；冬书房为短期设置，只在冬天开办。教学内容有经文、拉丁文、蒙文、音乐和林木等。育婴堂收养的孩子，长大成人后，由教堂做主择配出聘。到鄂托克旗解放，育婴堂共收养80名婴幼儿。
1934年，葛永勉司铎，在包日巴拉嘎苏教堂成立印书馆，馆长哈热巴斯，有5名技术工人。至鄂旗解放，印书堂共印11种蒙文书籍，即《古经大略》《新经大略》《家教》《简言要略》《圣人言行》《一目了然》《劝教书》等，还有3种有关蒙古族历史的书籍。
1941年，贺歌南司铎，在包日巴拉嘎苏教堂，建立一座蒙古族小学，为4年制，学校起初全部为免费。学习科目有文学、历史、数学、地理、生理卫生、音乐、拉丁文等。教学课本全部由教师自己翻译、印刷。学校历任主管教师有贺歌南、马如龙；教师有森格、吴瑞明（蒙名沙格都斯仁）、郝生金（蒙名布仁特古斯）、金汉文（蒙名哈拉珍），这些人后来都参加了革命。教师还有乌力吉青克勒（汉名吴海富，后任伪保长）、美热根巴娃等。
同年，贺司铎与鄂旗王爷旺庆扎布协商创办一所医院，地点定在哈日根图，因哈日根图庙喇嘛的反对，改建在新寨子。医院一直开办到鄂旗解放。医生曾有贺歌南、马如龙；护士有阿格达、马·玛丽亚、希克热等。医院有注射器件，内服、外用药品，以西药为主，药品主要是从上海、天津等城市运来。
五、反天主教运动
1900年，义和团和红灯照等爱国组织的成员来到鄂托克地区，与当地独贵龙组织联合，提出“上打洋人，下打官”的号召，开始反洋教运动。当时闵玉清司铎派中间人任海龙，带着礼品同独贵龙和谈，遭到拒绝，任海龙被杀，和谈失败。阴历七月十五日，独贵龙和红灯照烧毁包日巴拉嘎苏教堂、克泊日、小石砭教堂和一些教民的房屋。十八日开始围攻小桥畔主堂，双方对峙48天，这次运动被官府镇压。
1901年，西南蒙古教区南段的赔款会盟在柠条梁教堂举行。会期为1个月，参加会盟的各方代表有：直隶候补知府寿勋，署理山西绥道遇缺即补到曹受培，秦保知府斌义等；绥远右翼城佐领图伽布、归化城左翼佐领扎拉丰阿，伊盟盟长和副盟长拉希扎木苏及各有关旗代表。教会方面的代表有杨光被、巴士英二司铎；教民代表有闫炳成、李钰、张大臣等。经过谈判，于1901年5月28日签订《柠条梁和约》，其中规定伊盟各旗赔款590500两白银，鄂托克旗赔款84000两，是赔款最多的旗。由于鄂托克旗拿不出这笔巨款，除了部分以牲畜作抵押外，其余以20年为限，用土地作抵押。
这片土地是西北至喇嘛圪堆子，东北至浩雅热乌素堆子，西南至杨湾堆子，东南至草山梁（蒙名班乌拉），共248平方公里。后来鄂旗王爷因向教堂借银还不起，于1904年，把哈热希里、巴音都克木、哈热呼德3个平川作典押，顶1000两白银。同年，鄂旗王爷把东自巴音都克木、西至伊登音浩赖25公里，南自德热布伊克浩赖、北至克珠日庙塔拉（克珠日畔驮盐路），宽15公里，共375平方公里的土地，以4700两纹银卖给教堂。
教堂得到这些土地后，开始开荒种地。以2∶8或3∶7股租给比较富裕的教民；这些教民再按3∶7或2∶8股租给贫穷的教民租种。秋收后先上缴教堂股子，然后教民之间分股。当时租种的土地有：黑梁头、章昂希里、克珠日、黄海滩（蒙名沙热扎达亥）、黑圪塔（蒙名哈日陶勒盖）、苏坝海子、黄蒿塘（蒙名哈热呼德）。
1935年，鄂托克旗旗务帮办章文轩欲收回赔教地，经多次与教堂谈判，达成协议，即从1935年起，每年正月教堂向旗府上缴1000元的牛犋租银，同时把包日巴拉嘎苏教区的教民编为1个苏木，归旗府管辖。1943年冬，又成立两个保，1个设在包日巴拉嘎苏，历任保长有特布兴德利格热、胡维成、钦克等，下设8个甲；另一个保设在黑梁头。
1946年7月4日，中央陕甘宁边区在安边成立三边收回教区土地委员会。7月9日决定把推子梁、白泥井、小桥畔、柠宁梁等教区划归三边管辖。8月5日再次决定将包日巴拉嘎苏教区正式划归鄂托克旗管辖。
六、49年后天主教的状况
中华人民共和国成立后，外国神职人员全部离境。1958—1963年，教务活动基本停止。1966年，“文化大革命”开始，神职人员被批斗、专政。
1978年后，落实宗教政策，恢复教务活动。1983年，由内蒙古天主教爱国委员会拨款5000元，当地教民捐资3000元，在城川苏木糜地梁嘎查的包日嘎图建起一座小教堂，本堂神父马仲牧（蒙名特古斯毕利格）。1985年教堂倒塌。1986年，由伊盟民委拨款1万元，当地教民捐7千元，重新建起一座6间房的教堂和2排宿舍。现有堂有神父1名，修女4名（她们的名字叫扎娃、嘎德热娜、希克热、马·玛丽亚），还有2名孤儿。教堂有教民4000人。一切教务活动均在教堂进行，神职人员每月由政府发给13元的生活补助费。
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